由于皇宫人员众多，六月十五日下午，崇祯召集曹化淳，刘文忠，李凤翔等太监主管，安排迁都之前的准备。
宫女有许多年龄较大，崇祯让曹化淳按照自愿原则，提交宫女放归的名单。部分年龄过大的宫女太监，会留守皇宫。即使如此算下来，整个皇宫需要迁移的人员，大约在六万人以上。这其中包含锦衣卫近万人。
皇宫的搬迁，只是一部分。崇祯还要考虑大明皇家研究院是否需要搬迁。最终宋应星的方案是大部分人员迁到南京，少部分留在京城。
皇家研究院不在迁都名单之中，可以自行决定搬迁时间。宋应星从六月二十日，就开始让研究院部分人员搬迁。这次搬迁不会影响京津铁路的建设。
规模更庞大的人员是京营和家属。考虑到运河的实际通行能力和船只数量，京营的搬迁需要半年以上分批迁移。
即使是六部等官府，也要分成数批搬迁。崇祯七年的会试，将在南京城举办。也在官府的邸报中公开了。
从六月十六日开始，京城陷入了大搬迁之前的忙碌。很多房屋要出售，但没有实际的买家。一场人为的市场萧条，在京城产生。
迁都的消息，象台风一样扫过。将影响到大明的方方面面。刘若宰一下子成了官场声明卓著的名人，前途无量。
上次崇祯南巡，规模就是数万人。而这次迁都，总人数远远超过那次。即使时间跨度延长，如此大规模的人员流动，对大明也是很少见的。一路三千余里，以运河的运行能力，不可能承担如此的规模。好在近年船运发展快速，部分人员可以从天津海运到南京。
短短三天，京城的粮价下跌了一成，而销售量更是大量减少。许多外地商人，更是提前开始从京城撤离部分人员。到南京购买商铺的商队，更是从十六日下午就已经出发。
这次迁都，影响最大的，就是以英国公，成国公为首的勋贵。这些勋贵的产业，全部在北直隶一带。部分勋贵参与了海外建藩。部分中级勋贵还没有在海外建藩。从明年开始所有勋贵的禄米也会停发。京营的军官在南京没有房子，这些问题都是不小的问题。
五十万人的大规模迁移，远比五十万大军行动要复杂数倍。去年的海外移民，是多半年时间，总移民人数约六十万。如果不是有近几年的移民经验，这次迁都要更加混乱。
而迁都受益最大的，是经营异地汇兑的大明皇家钱庄。真正要运送大量白银到南京，费用远高于百分之三的汇兑费用。于是从六月十五日下午开始，到钱庄办理汇兑业务的客户就大幅度增加。当然，钱庄也不用实际运输白银到南京。南方的白银流通量很高。钱庄有很多办法，可以使南方的白银留在南方。这样实际上真正需要平衡的白银数量会很少。
以崇祯在南方的收入而言，金花银一百多万两，南直隶的皇庄变卖每年也是不会低于二百万两，南京的钱庄客户存款，存银，如果真的存在巨大的白银缺口，还可以通过海运及时运输白银。
陈大金此时就日夜住在钱庄总部，也已经将快信发到南京钱庄，让陈承芳留意南京钱庄的白银数量。
六月二十一日，钱庄开出的汇票总额达到二百万两。此时钱庄汇兑，会每隔一天，将汇票存根，派专人送到南京。而以前是每五天送一次。六月二十六日，钱庄开出的汇票总额达到五百万两。从六月二十七日开始，汇票开出的速度大幅度下降。这么多的白银数量，完全在可以应付的范围之内。
钱庄是收白银，出银币。这就有百分之八左右的利润。在加上百分之三的汇兑费用，纯利润大约是百分之十。短短数天，钱庄盈利达到五十万两。
此时大明的物资交易，南直隶就是交易中心。而京城原本是北方白银流通中心，每年原本留入户部的白银数量，崇祯元年约八百万两，崇祯五年约五百多万两。因此上钱庄才有实力进行异地汇兑。当白银出现单方面流动时，没有足够的实力很难开展异地汇兑业务。
一方面此次迁都是半迁半留，另一个方面很多勋贵的白银会自己运输。所以短时间的汇票总额，没有超出钱庄的应对能力。
而此时其他钱庄陷入了纠结之中，迁都一方面会让京城的业务下降，如客户存款下降（此时钱庄存银会收取保管费），如果想将业务扩展到南京会有很多困难。
皇家钱庄的优势，在迁都中得到发挥。白银铸造数量和客户群体迅速扩张。而皇家研究院的南迁，也给钱庄的异地汇兑带来好处。研究院的收入，可以暂时应对两地的白银储存差异。
六月二十九日，搬迁即将开始。陈大金向崇祯请示，北京钱庄六百万以上的银币如何处理（原本账目上就有存银）。
这些存银，如果南京没有大笔白银需要汇到京城，而陈承芳在南京可以应对客户的白银需求。崇祯就可以利用这些白银。这些钱庄都是崇祯的财产。即使库房保留一定白银应急，五百万两白银，在当时仍然是一笔巨款。要知道，数年以前的辽饷，只有不到五百万两。
准备投资的京津铁路，预算不超过八十万两。此时北方水田的价格约在十二两一亩，旱田的价格在三到五两。
崇祯询问了南京钱庄目前的资金状况，最终决定先留下一百万资金满足京津铁路，再留下五十万资金应急。拿出四百万资金，成立大明农业钱庄，将资金借贷给皇庄佃户，用来购买皇庄田地。皇庄多是水田，价格定在十二两每亩。而近年皇庄小麦产量多在二石以上，按照北直隶粮价约值白银三两。当然实际的农业利润远低于三两。甘薯的产值略低于三两。
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