在进军关中的同时，更始帝派定国上公王匡攻打洛阳，而新莽太师王匡也驻守洛阳，试想一下，当时双方通报姓名有多尴尬：
“来者何人？我刀下不杀无名小卒，速速报上名来！”
“我乃大将王匡，你是何人？”
“我乃大将王匡，你是……”
“传我军令，杀王匡，不，杀对面王匡者，黄金万两。”
汉军强攻洛阳，王匡、哀章被生擒活捉，押回宛城斩首。京师仓守将听说王莽已死，也开城投降，刘玄出于统战目的，封他们为列侯。关东的莽军余部或死或降，在昆阳之战中败退的庄尤、陈茂，逃至沛郡，两人一合计，就投了在汝南称帝的刘望。但是没过几天，更始军紧随而至，刘望覆亡，庄尤、陈茂双双战死。
此时天下州郡大多归附或者表示拥护，更始政权在名义上统一了全国，刘玄准备移驾洛阳。洛阳，早在始建国四年，被王莽钦定为东都，这是模仿周朝的东西并重格局。为了顺利实施计划，他又使出了拿手好戏——符命，声称得到了一块玄龙石，上面写着“定帝德、国雒阳”，这是天命，谁敢违抗？
西汉的洛阳城承袭自东周的洛邑城，东周灭亡后，成为吕不韦的食邑，吕不韦对其进行了扩建。西汉初年，刘邦准备定都洛阳，驻跸吕不韦的府邸，后来称为洛阳南宫。王莽自天凤元年起，派遣大司空王邑等，在旧洛阳城的基础上，勘测风水，再次进行扩建。
坐冷板凳的刘秀被重新起用，以代理司隶校尉之职赴洛阳。司隶校尉就是长安、洛阳直辖区的监察长官。刘秀带上新婚的阴丽华，收拾旧部，再次踏上征途。王霸原本在昆阳之战后，解甲归田，不料刘縯被杀，他对刘玄大失所望，再度来归。
刘秀还记得与冯异的约定，只是几个月过去了，他会不会已经降了别部？当刘秀行至父城，见更始军仍在作战，一问之下，才知道冯异一直在坚守城池。
刘秀单骑来到城边，大呼：“冯将军别来无恙啊！”冯异心领神会：“听说刘将军处理家事去了，可还顺利？”刘秀说道：“无妨无妨，陛下已任命我为司隶校尉，巡察洛阳，冯将军何不早降，报效朝廷？”冯异与苗萌对视一眼，随即开城投降。冯异在刘秀帐下担任主簿，又推荐了颍川名士铫（读作姚）期等人。
铫期字次况，颍川郡郏县人，身高八尺，威风凛凛。他的父亲铫猛，曾任桂阳太守，去世后，铫期服满三年丧期，为乡人所称道。刘秀任命他为贼曹掾，负责治安事宜。正好，身边的臧宫是他的老乡，性情也差不多，打趣道：“老兄你比我落后啦，我可是早就认准明主了”。大家一扫往日的阴霾，开怀大笑起来。马成则就地调任郏县令，料理善后事宜。
刘秀到达洛阳，整修宫室，恢复秩序，准备迎接刘玄君臣。关中父老们一早得到消息，不顾路途远近，赶到洛阳城中夹道欢迎，这不仅是一场入城仪式，更是一场时装发布会。不拘小节的绿林好汉们，衣冠不整，吊儿郎当，甚至穿着女人的衣服招摇过市，这种农村非主流的风格，把大家都看呆了，没见过世面的甚至吓得调头就跑。
再看司隶校尉刘秀的官属，文官玄衣进贤冠，武官绛衣鹘尾冠，整齐划一，端端正正，心里舒服多了。怀旧的老人们不禁潸然泪下：“不图今日复见汉官威仪！”虽然不能以貌取人，但是仪容仪表却最能直观地表现出人的精神状态，马上就要进城接管政权了，丝毫松懈不得。
洛阳遍地流民，又经数月鏖战，萧条破败，不复往日繁华。刘秀整顿机构，行文各地，依西汉旧法行事，为自己赢得了人心，也积累了行政经验。
刘玄俨然天下共主，不过屁股坐得稳不稳，他自己心里清楚，山东、河北的豪强和农民军是心腹大患。他遣使招抚赤眉军，首领樊崇等人本来也只是找条活路，既然天子来召，那就去吧，拜将封侯什么的，想想还有些小激动呢。
等他们到了洛阳，刘玄倒是客客气气，一个个给他们封了侯，可是绿林诸将的眼睛里充满着猜忌，老子打的江山老子坐！最后重蹈王莽的覆辙，画饼充饥，有封爵而无食邑。樊崇好气啊，心想我们赤眉军的兵力比你们绿林军强，别给脸不要脸，当即反出洛阳，回山东去了。
赤眉军大举西进，攻入颍川郡，而后兵分两路，一路南下进入南阳郡，杀宛城县令，一路北上进入河南郡（洛阳地区），杀河南太守。面对赤眉军满山遍野的大部队，更始各部兵力分散，被打个措手不及，眼看都打到家门口了，刘玄如坐针毡。
丞相司直李松建议迁都长安，刘玄遂派李松代行丞相之职，先到长安安排迁都事宜。因为更始诸将都是关东人，他们听说此事后都表示反对，朝堂之上吵吵嚷嚷。这时，有一个人力挺迁都，他是李松的长史郑兴。
郑兴字少赣，河南郡开封人，先学《公羊传》，后学《左传》，成为这方面的专家。天凤年间，他又师从刘歆深造，刘歆发现了他的才能，让他整理经学章句、训诂，并校订古历。
这样一位熟悉掌故的人，说起迁都长安的理由，自然头头是道。他说：“陛下初起兵时，政权未立，然而登基不久，关中豪杰就诛杀王莽，开关迎驾，为何？这是因为天下共苦王莽暴虐，思念汉朝旧德。如今若不安抚他们，臣恐怕百姓离心，盗贼再起。《春秋》讲齐桓公回国争位，写作‘齐小白’，而不写‘齐侯’，就是没有告祭宗庙，名不正言不顺的缘故。有人说应该先定赤眉再入关中，是舍本逐末，若关中有失，将来洛阳岂能高枕无忧？愿陛下三思。”
他的话至少在当时是有道理的。长安是西汉旧都，王朝正统所在，洛阳在天下之中，很容易四面受敌。刘玄一握拳：“朕意已决，迁都长安！”于是拜郑兴为谏议大夫，安抚关中、朔方、凉州和益州。
刘玄虽然懦弱，却并非没有脑子，他也知道绿林军的大爷们是一帮坑爹货，于是开始提拔宗室，以刘赐为丞相，刘终为侍中，刘嘉为大将军，刘顺为虎牙将军，玩起了平衡手。朝中的局势渐渐变得微妙起来。
刘秀将借助这微妙的局势重整旗鼓。在代理司隶校尉期间，他忠于职守，规规矩矩，将对大哥的哀思深藏心底，只是在深夜人静的时候暗自垂泪。冯异是个精细人，他与刘秀私下相处时，看见枕席上隐隐有泪痕，便宽慰刘秀：“明公请节哀顺变。”刘秀故作镇定：“你不要胡说，我很好。”冯异也不纠缠，又说：“明公既有大志，如今尚书曹诩父子，在宫中用事，可以结交他们，以备不时之需。”刘秀默默点了点头。
机会不期而至，由于之前派出的一批使者没有取得预期效果，刘玄准备再派得力人手招抚河北，稳定人心。丞相刘赐为代表的宗室集团，极力推荐刘秀，说他文武双全，又有威望，是合适的人选；而部分绿林军将领，对此坚决反对，说他功高震主，心机深沉，不可放虎归山。刘玄犹豫不定，便咨询近臣，曹诩小心翼翼地说：“一笔写不出两个刘字，刘秀感念陛下不杀之恩，自然没有二心。倘若换了别人去，岂不坏了大事？”
刘玄终于让刘秀代行大司马，持节巡行河北，但出于防范心理，并未授予军队。刘秀只能带着官属和少量卫队出发，然而这对他来说，已经足够了。临行前，刘秀辞别阴丽华：“丽华，此去前途未卜，不知何日是归期。”阴丽华说：“好男儿志在四方，我等着你。”因为一个人在洛阳不方便，刘秀让阴丽华返回新野，当时阴识任偏将军，可以善加保护。
，一遇风云便化龙。
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