王嘉胤并不清楚苏越所谓的时机没到是什么意思，但是他倒是很敏锐的意识到，这场战争背后也许是个阴谋。
这场围城战从三月下旬一直延续到了四月末，马六甲城地区属于热带雨林气候，基本每日上午闷热晴朗，接着天空的积雨云越积越厚，午后则暴雨倾盆，大雨过后天气变得凉爽，第二天又继续如此。
这样的天气给亚齐人造成了很大的麻烦，不过在大明派出的军官帮助下，这一次的亚齐军总算学会了修建一个不会积水的军营，并将疫病者隔离开来。
亚齐苏丹伊斯坎达穆达终于忍耐不住，带着自己的宫廷跨越了海峡，来到了马六甲河西岸督促战争。
五月一日上午，伊斯坎达穆达前往了马六甲城的外城区，试图鼓励自己的将士继续把战争进行下去。不过这显然是一个错误的决定，在他巡视的过程中，发生了一次猛烈的爆炸，这次爆炸不仅将伊斯坎达穆达送上了天堂，就连跟随苏丹一起巡视的宫廷大臣们也死伤惨重。
亚齐苏丹的外甥伊斯坎达塔尼和马勒穆达、贾帕克互相指责是对方布置了这场爆炸，就在双方剑拔弩张就要在葡萄牙人眼皮底下进行火拼时，王嘉胤率领着八百人插入了双方之间，让双方暂时冷静了下来。
随后，苏越和杨天生邀请了双方进行谈判。在他们的调停之下，马勒穆达、贾帕克决定向伊斯坎达塔尼宣誓效忠，作为回报他们将获得南苏门答腊的统治权力。
伊斯坎达塔尼获得了亚齐苏丹的继承权后，便和马勒穆达、贾帕克一起向士兵宣布，苏丹伊斯坎达穆达实际上是被葡萄牙人的火炮击中了，并非死于阴谋。
三人还向士兵们宣布，由于苏丹的死亡，所以战争结束了。他们将会把苏丹的尸体送回亚齐，而各位士兵回到亚齐后，都将会从国库里获得一份奖励。
三位统帅大军将领的一致宣告，很快就将亚齐士兵们给安抚了下来。在葡萄牙人的城堡下磨了一个多月后，糟糕的气候和葡萄牙人的防御，让亚齐士兵再一次失去了作战的勇气，开始担忧起葡萄牙人的援军会不会到来了。
苏丹的死亡，更是让这些士兵们想要尽快回家，离开这个不详之地。因此在听了三名将领的共同宣告之后，士兵们很快就承认了新苏丹的诞生和军队撤兵的决定。
伊斯坎达塔尼、马勒穆达、贾帕克三人都在第一时间陪同着前苏丹的尸体过了海峡，希望能够早日让国内接受他们在马六甲城下达成的协议。
三人只带走了自己最亲信的部队，这导致还有上万人被遗留在了马六甲城下。这些亚齐人很快就被苏越雇佣了下来，随即就被指派给了王嘉胤去率领。
王嘉胤此次从台湾带出了两个移民和罪犯组成的营级单位，一个投靠大明的高山生番组成的突击大队，总计1八00人左、右。
在重新规划了围城阵型之后，王嘉胤便竖起了大明的旗帜，然后派人向圣保罗山上城堡内的葡萄牙人喊话，要求他们无条件投降，则大明将保证他们的生命安全和个人财物。
明人的喊话除了得到葡萄牙人的数发子弹之外，并没有得到什么其他回应。看起来城堡内的葡萄牙人都非常强硬，大有死守到底的气势。
但事实上，法摩沙城堡内也是快到了崩溃的边缘。澳门复国委员会的代表阿戈斯蒂纽，早在半年多前就来到了马六甲城。
{}/ 而即便是换了明军上来，王嘉胤身边的参谋人员也认为，凭借人力是无法攻破这座城堡的。除非将船上的重炮搬迁下来，然后筑造和城墙高度相仿的炮垒，一点一点的将城堡构造给轰烂，才有可能攻下这座堡垒。
事实上，他们这次进攻已经占据了便宜，在上次马六甲城被亚齐围攻之后，葡萄牙人已经着手在河口的岛上再修筑一座炮台，以控制港口并和圣保罗山上的城堡互相支援。
只不过葡萄牙人的官僚主义，使得这座炮台尚没有完成，连放在河口附近的1门大炮都被亚齐人给缴获了。
不过再坚固的城堡，一旦出了内鬼，那也是守不住的。在阿戈斯蒂纽的策划下，当晚1点钟左右，驻守第一、第二防线的巴雷托上尉带着部下打开了大门，把明军放进了城堡。
这座城堡的第三道防线，其实是圣保罗山被削平的山头，那里不仅是一座的广场，还有总督府、武器库、达官贵人的住所和一个教堂。
哪怕是失去了第一、第二防线，马六甲总督也带着亲信守到了天亮。只不过这上面最多也就、百人把守，当那些台湾高山族出身的士兵攀爬到山头上时，躲进了总督府的葡萄牙显贵终于打出了白旗。
城堡内的国库虽然还不到0万克鲁扎多，但是从这些被俘的达官贵人家中却搜出了价值三、四百万两白银的财物。光是马六甲总督一个人就贡献了这些财物的六分之一，相当于他100年的总督俸禄。
国库里的钱被赏赐给了城外的士兵，巴雷托上尉及其部下4人分得了50万两。虽然这个数字并没有达到阿戈斯蒂纽承诺的数字，不过这些葡萄牙官兵并没有提出异议。
对于被俘虏的葡萄牙人和投降的葡萄牙军人，苏越给了他们一个选择，愿意效忠伊莎贝拉殿下的就送去澳门，不愿意的便送他们去果阿。
大约有五分之三的葡萄牙人表示愿意效忠伊莎贝拉殿下，愿意为复国贡献自己的力量。这些人在失去了自己的财产后已经一无所有，即便是去了果阿也要变成乞丐，因此想要留下来碰碰运气。
至于另外五分之二的葡萄牙人，大多在果阿还有亲戚，并不愿意去冒险追随不知真假的伊莎贝拉殿下。
众人接下来商议之后，决定让杨天生护送150万两白银回国贡献给皇帝陛下，并请求将安不纳镇守府提升为南洋巡阅府，迁移到马六甲城来。
作为四海贸易公司的代表，在攻下了马六甲城之后，苏越便第一时间宣布下调了马六甲的各项税务，并将马六甲城周边的一些土地分配给了华人和向大明效忠的亚齐人。
此外他还派人去接回了柔佛苏丹，在马六甲城重建了马六甲苏丹国，不过这个苏丹国就处在大明的保护之下了。至于亚齐王国，因为苏丹的死亡，内部也开始了不断的斗争，国势一时大不如前。
借助亚齐王国势力，在苏门答腊和马来地区进行垄断贸易的天方商人，也不得不退让出了许多地方给华商经营贸易，其中最受打击的正是印度棉布生意。
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